Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa13P50711 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa13P50711 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Defa13P50711 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa13P50711 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa13P50711 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa13P50711 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa13P50711 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa13P50711 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa13P50711 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms