Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17,69■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,68■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,67■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,65■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17,65■□□□□ 0,42
Defa9P50707 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,64■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,63■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Defa9P50707 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17,62■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,62■□□□□ 0,41
Defa9P50707 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,6■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,41
Defa9P50707 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,58■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,56■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,4
Defa9P50707 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17,52■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,51■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa9P50707 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa9P50707 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Defa9P50707 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17,45■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Defa9P50707 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17,4■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Defa9P50707 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,9 ms