Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psen1P49769 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psen1P49769 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psen1P49769 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psen1P49769 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psen1P49769 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psen1P49769 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psen1P49769 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psen1P49769 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psen1P49769 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psen1P49769 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psen1P49769 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Psen1P49769 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psen1P49769 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psen1P49769 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psen1P49769 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psen1P49769 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psen1P49769 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psen1P49769 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psen1P49769 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psen1P49769 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Psen1P49769 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psen1P49769 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psen1P49769 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms