Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdcd2P46718 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdcd2P46718 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdcd2P46718 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcd2P46718 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd2P46718 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd2P46718 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1314.6 ms