Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfsf4P43488 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnfsf4P43488 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnfsf4P43488 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnfsf4P43488 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnfsf4P43488 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnfsf4P43488 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnfsf4P43488 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms