Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nkx1-2P42580 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Nkx1-2P42580 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nkx1-2P42580 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nkx1-2P42580 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nkx1-2P42580 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nkx1-2P42580 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nkx1-2P42580 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms