Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc19a1P41438 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc19a1P41438 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc19a1P41438 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc19a1P41438 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc19a1P41438 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc19a1P41438 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms