Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox7P40646 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sox7P40646 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox7P40646 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox7P40646 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox7P40646 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox7P40646 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox7P40646 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox7P40646 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sox7P40646 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sox7P40646 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sox7P40646 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sox7P40646 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox7P40646 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox7P40646 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sox7P40646 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sox7P40646 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox7P40646 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox7P40646 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox7P40646 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox7P40646 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox7P40646 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox7P40646 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox7P40646 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox7P40646 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox7P40646 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox7P40646 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox7P40646 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox7P40646 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms