Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdha1P35486 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdha1P35486 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdha1P35486 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdha1P35486 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdha1P35486 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdha1P35486 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdha1P35486 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms