Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PpardP35396 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PpardP35396 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PpardP35396 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PpardP35396 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PpardP35396 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PpardP35396 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PpardP35396 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PpardP35396 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PpardP35396 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PpardP35396 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PpardP35396 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PpardP35396 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PpardP35396 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PpardP35396 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PpardP35396 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PpardP35396 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PpardP35396 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PpardP35396 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PpardP35396 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PpardP35396 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PpardP35396 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PpardP35396 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PpardP35396 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PpardP35396 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PpardP35396 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PpardP35396 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PpardP35396 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PpardP35396 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PpardP35396 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PpardP35396 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PpardP35396 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PpardP35396 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PpardP35396 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PpardP35396 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PpardP35396 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PpardP35396 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PpardP35396 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PpardP35396 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PpardP35396 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PpardP35396 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PpardP35396 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PpardP35396 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PpardP35396 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PpardP35396 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PpardP35396 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PpardP35396 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PpardP35396 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PpardP35396 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PpardP35396 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PpardP35396 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PpardP35396 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PpardP35396 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PpardP35396 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PpardP35396 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PpardP35396 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PpardP35396 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PpardP35396 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PpardP35396 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PpardP35396 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PpardP35396 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PpardP35396 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PpardP35396 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PpardP35396 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PpardP35396 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PpardP35396 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PpardP35396 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PpardP35396 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PpardP35396 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PpardP35396 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PpardP35396 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PpardP35396 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PpardP35396 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PpardP35396 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PpardP35396 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PpardP35396 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PpardP35396 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PpardP35396 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PpardP35396 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PpardP35396 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PpardP35396 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PpardP35396 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PpardP35396 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PpardP35396 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PpardP35396 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PpardP35396 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PpardP35396 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PpardP35396 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PpardP35396 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PpardP35396 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PpardP35396 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PpardP35396 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PpardP35396 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PpardP35396 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PpardP35396 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PpardP35396 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PpardP35396 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PpardP35396 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PpardP35396 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PpardP35396 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms