Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab20P35295 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab20P35295 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab20P35295 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab20P35295 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab20P35295 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab20P35295 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab20P35295 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab20P35295 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab20P35295 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab20P35295 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab20P35295 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab20P35295 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab20P35295 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab20P35295 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab20P35295 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rab20P35295 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rab20P35295 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab20P35295 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab20P35295 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab20P35295 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab20P35295 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab20P35295 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab20P35295 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms