Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DesP31001 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DesP31001 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DesP31001 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DesP31001 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DesP31001 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DesP31001 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DesP31001 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DesP31001 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DesP31001 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DesP31001 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DesP31001 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DesP31001 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DesP31001 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DesP31001 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DesP31001 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DesP31001 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DesP31001 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DesP31001 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DesP31001 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DesP31001 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DesP31001 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DesP31001 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DesP31001 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DesP31001 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DesP31001 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DesP31001 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DesP31001 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DesP31001 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DesP31001 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DesP31001 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DesP31001 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DesP31001 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DesP31001 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DesP31001 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DesP31001 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DesP31001 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DesP31001 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DesP31001 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DesP31001 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DesP31001 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DesP31001 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DesP31001 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DesP31001 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DesP31001 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DesP31001 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DesP31001 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DesP31001 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DesP31001 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DesP31001 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DesP31001 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DesP31001 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DesP31001 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DesP31001 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DesP31001 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DesP31001 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DesP31001 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DesP31001 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DesP31001 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DesP31001 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DesP31001 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DesP31001 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DesP31001 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DesP31001 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DesP31001 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DesP31001 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DesP31001 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DesP31001 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DesP31001 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DesP31001 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DesP31001 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DesP31001 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DesP31001 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DesP31001 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DesP31001 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DesP31001 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DesP31001 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DesP31001 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DesP31001 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DesP31001 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DesP31001 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DesP31001 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DesP31001 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DesP31001 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DesP31001 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms