Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp2P29594 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp2P29594 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp2P29594 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp2P29594 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp2P29594 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp2P29594 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp2P29594 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp2P29594 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casp2P29594 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp2P29594 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp2P29594 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp2P29594 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp2P29594 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp2P29594 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp2P29594 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp2P29594 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp2P29594 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp2P29594 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp2P29594 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp2P29594 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms