Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpbP28033 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CebpbP28033 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CebpbP28033 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpbP28033 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpbP28033 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpbP28033 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CebpbP28033 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CebpbP28033 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CebpbP28033 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpbP28033 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CebpbP28033 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CebpbP28033 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CebpbP28033 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CebpbP28033 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CebpbP28033 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CebpbP28033 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CebpbP28033 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CebpbP28033 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms