Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vav1P27870 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vav1P27870 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vav1P27870 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Vav1P27870 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vav1P27870 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vav1P27870 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vav1P27870 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vav1P27870 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vav1P27870 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vav1P27870 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vav1P27870 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vav1P27870 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vav1P27870 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Vav1P27870 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vav1P27870 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vav1P27870 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vav1P27870 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vav1P27870 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vav1P27870 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vav1P27870 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vav1P27870 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vav1P27870 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms