Protein–RNA interactions for Protein: P22682

Cbl, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CblP22682 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CblP22682 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CblP22682 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CblP22682 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CblP22682 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CblP22682 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CblP22682 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CblP22682 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CblP22682 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblP22682 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblP22682 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblP22682 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblP22682 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CblP22682 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblP22682 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblP22682 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CblP22682 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CblP22682 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CblP22682 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CblP22682 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CblP22682 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CblP22682 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CblP22682 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CblP22682 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CblP22682 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblP22682 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblP22682 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblP22682 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CblP22682 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CblP22682 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CblP22682 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CblP22682 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CblP22682 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CblP22682 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CblP22682 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblP22682 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblP22682 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblP22682 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CblP22682 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CblP22682 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CblP22682 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CblP22682 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CblP22682 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CblP22682 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CblP22682 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CblP22682 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CblP22682 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CblP22682 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CblP22682 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CblP22682 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblP22682 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblP22682 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblP22682 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CblP22682 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CblP22682 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblP22682 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblP22682 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CblP22682 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CblP22682 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CblP22682 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblP22682 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblP22682 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CblP22682 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblP22682 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblP22682 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblP22682 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CblP22682 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CblP22682 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CblP22682 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CblP22682 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CblP22682 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CblP22682 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CblP22682 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblP22682 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblP22682 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CblP22682 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CblP22682 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CblP22682 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CblP22682 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CblP22682 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CblP22682 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblP22682 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CblP22682 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CblP22682 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CblP22682 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms