Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkcaP20444 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkcaP20444 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkcaP20444 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcaP20444 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcaP20444 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcaP20444 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcaP20444 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms