Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
F2P19221 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F2P19221 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F2P19221 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F2P19221 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F2P19221 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F2P19221 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F2P19221 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F2P19221 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F2P19221 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F2P19221 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F2P19221 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F2P19221 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F2P19221 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F2P19221 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F2P19221 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F2P19221 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F2P19221 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F2P19221 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F2P19221 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F2P19221 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F2P19221 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F2P19221 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F2P19221 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F2P19221 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F2P19221 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F2P19221 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F2P19221 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F2P19221 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
F2P19221 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F2P19221 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F2P19221 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F2P19221 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F2P19221 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F2P19221 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F2P19221 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F2P19221 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F2P19221 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F2P19221 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F2P19221 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F2P19221 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F2P19221 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
F2P19221 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F2P19221 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F2P19221 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
F2P19221 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F2P19221 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
F2P19221 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
F2P19221 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F2P19221 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F2P19221 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
F2P19221 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F2P19221 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
F2P19221 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
F2P19221 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F2P19221 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
F2P19221 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
F2P19221 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F2P19221 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F2P19221 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
F2P19221 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
F2P19221 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
F2P19221 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F2P19221 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
F2P19221 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
F2P19221 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P19221 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P19221 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
F2P19221 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P19221 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
F2P19221 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P19221 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
F2P19221 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P19221 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
F2P19221 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P19221 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P19221 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
F2P19221 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
F2P19221 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms