Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ca3P16015 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ca3P16015 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ca3P16015 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ca3P16015 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ca3P16015 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ca3P16015 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ca3P16015 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ca3P16015 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ca3P16015 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca3P16015 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ca3P16015 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ca3P16015 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ca3P16015 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ca3P16015 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ca3P16015 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ca3P16015 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ca3P16015 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ca3P16015 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms