Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChgbP16014 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChgbP16014 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChgbP16014 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChgbP16014 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChgbP16014 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChgbP16014 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChgbP16014 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ChgbP16014 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ChgbP16014 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChgbP16014 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChgbP16014 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChgbP16014 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgbP16014 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChgbP16014 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChgbP16014 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChgbP16014 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChgbP16014 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms