Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim30aP15533 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim30aP15533 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim30aP15533 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim30aP15533 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim30aP15533 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms