Protein–RNA interactions for Protein: P11881

Itpr1, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr1P11881 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Itpr1P11881 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itpr1P11881 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itpr1P11881 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itpr1P11881 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itpr1P11881 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itpr1P11881 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itpr1P11881 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itpr1P11881 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms