Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Col1a1P11087 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Col1a1P11087 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Col1a1P11087 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Col1a1P11087 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Col1a1P11087 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Col1a1P11087 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col1a1P11087 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Col1a1P11087 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Col1a1P11087 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Col1a1P11087 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Col1a1P11087 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,5 ms