Protein–RNA interactions for Protein: P0C7L0

Wipf3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wipf3P0C7L0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wipf3P0C7L0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wipf3P0C7L0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Wipf3P0C7L0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wipf3P0C7L0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wipf3P0C7L0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wipf3P0C7L0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Wipf3P0C7L0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms