Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt4P07744 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt4P07744 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt4P07744 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt4P07744 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt4P07744 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt4P07744 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt4P07744 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt4P07744 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt4P07744 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt4P07744 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt4P07744 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt4P07744 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt4P07744 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt4P07744 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt4P07744 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt4P07744 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt4P07744 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms