Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
P06324 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
P06324 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
P06324 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
P06324 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
P06324 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
P06324 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
P06324 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
P06324 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
P06324 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
P06324 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
P06324 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
P06324 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
P06324 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
P06324 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
P06324 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
P06324 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
P06324 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
P06324 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
P06324 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
P06324 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
P06324 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
P06324 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
P06324 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
P06324 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P06324 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P06324 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
P06324 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
P06324 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
P06324 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
P06324 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
P06324 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
P06324 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
P06324 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23,23■■□□□ 1,31
P06324 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
P06324 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
P06324 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
P06324 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
P06324 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
P06324 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
P06324 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
P06324 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
P06324 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
P06324 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P06324 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P06324 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
P06324 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
P06324 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,16■■□□□ 1,3
P06324 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
P06324 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
P06324 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
P06324 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
P06324 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
P06324 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
P06324 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
P06324 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
P06324 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
P06324 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,13■■□□□ 1,29
P06324 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
P06324 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
P06324 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
P06324 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
P06324 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
P06324 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
P06324 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
P06324 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23,1■■□□□ 1,29
P06324 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
P06324 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
P06324 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
P06324 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
P06324 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
P06324 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
P06324 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
P06324 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
P06324 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
P06324 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23,08■■□□□ 1,29
P06324 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
P06324 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
P06324 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
P06324 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23,07■■□□□ 1,28
P06324 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
P06324 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
P06324 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
P06324 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
P06324 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23,05■■□□□ 1,28
P06324 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
P06324 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
P06324 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
P06324 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
P06324 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
P06324 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
P06324 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23,01■■□□□ 1,27
P06324 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
P06324 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
P06324 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
P06324 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
P06324 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
P06324 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
P06324 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
P06324 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,8 ms