Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ItgamP05555 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgamP05555 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgamP05555 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ItgamP05555 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ItgamP05555 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ItgamP05555 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ItgamP05555 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgamP05555 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgamP05555 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ItgamP05555 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ItgamP05555 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ItgamP05555 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ItgamP05555 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgamP05555 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ItgamP05555 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ItgamP05555 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgamP05555 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ItgamP05555 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ItgamP05555 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms