Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AfpP02772 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AfpP02772 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AfpP02772 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AfpP02772 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AfpP02772 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AfpP02772 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AfpP02772 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AfpP02772 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AfpP02772 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AfpP02772 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AfpP02772 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AfpP02772 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AfpP02772 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AfpP02772 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AfpP02772 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AfpP02772 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AfpP02772 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AfpP02772 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AfpP02772 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AfpP02772 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AfpP02772 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AfpP02772 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AfpP02772 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AfpP02772 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AfpP02772 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AfpP02772 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AfpP02772 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AfpP02772 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AfpP02772 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AfpP02772 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AfpP02772 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AfpP02772 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AfpP02772 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AfpP02772 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AfpP02772 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AfpP02772 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AfpP02772 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AfpP02772 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AfpP02772 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AfpP02772 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AfpP02772 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AfpP02772 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AfpP02772 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AfpP02772 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AfpP02772 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AfpP02772 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AfpP02772 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AfpP02772 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AfpP02772 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AfpP02772 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AfpP02772 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AfpP02772 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AfpP02772 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AfpP02772 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AfpP02772 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AfpP02772 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AfpP02772 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AfpP02772 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AfpP02772 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AfpP02772 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AfpP02772 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AfpP02772 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AfpP02772 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AfpP02772 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AfpP02772 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AfpP02772 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AfpP02772 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AfpP02772 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AfpP02772 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AfpP02772 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AfpP02772 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AfpP02772 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AfpP02772 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AfpP02772 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AfpP02772 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AfpP02772 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AfpP02772 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AfpP02772 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AfpP02772 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AfpP02772 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AfpP02772 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AfpP02772 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AfpP02772 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AfpP02772 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AfpP02772 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AfpP02772 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AfpP02772 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AfpP02772 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AfpP02772 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms