Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01798 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01798 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01798 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01798 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P01798 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01798 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01798 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P01798 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01798 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P01798 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01798 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01798 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
P01798 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01798 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01798 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01798 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01798 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01798 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01798 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01798 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01798 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01798 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01798 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01798 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01798 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01798 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01798 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01798 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01798 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01798 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01798 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01798 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01798 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01798 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01798 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01798 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01798 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01798 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms