Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20,35■□□□□ 0,85
P01660 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
P01660 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
P01660 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
P01660 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
P01660 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
P01660 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20,32■□□□□ 0,84
P01660 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
P01660 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
P01660 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
P01660 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20,31■□□□□ 0,84
P01660 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
P01660 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
P01660 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
P01660 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,3■□□□□ 0,84
P01660 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20,29■□□□□ 0,84
P01660 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
P01660 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
P01660 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
P01660 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
P01660 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,27■□□□□ 0,84
P01660 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,83
P01660 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20,26■□□□□ 0,83
P01660 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
P01660 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01660 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01660 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01660 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
P01660 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
P01660 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
P01660 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
P01660 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
P01660 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
P01660 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
P01660 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01660 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01660 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01660 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01660 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01660 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01660 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01660 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
P01660 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20,14■□□□□ 0,81
P01660 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
P01660 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01660 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01660 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01660 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01660 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
P01660 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
P01660 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,1■□□□□ 0,81
P01660 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
P01660 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20,1■□□□□ 0,81
P01660 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01660 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01660 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01660 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
P01660 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01660 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,81
P01660 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
P01660 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
P01660 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
P01660 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
P01660 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
P01660 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
P01660 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01660 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01660 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
P01660 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01660 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
P01660 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
P01660 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20,05■□□□□ 0,8
P01660 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01660 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
P01660 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20,02■□□□□ 0,8
P01660 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,1 ms