Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mtatp6P00848 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mtatp6P00848 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mtatp6P00848 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mtatp6P00848 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mtatp6P00848 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mtatp6P00848 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms