Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CopeO89079 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CopeO89079 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CopeO89079 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CopeO89079 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CopeO89079 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CopeO89079 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CopeO89079 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopeO89079 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopeO89079 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CopeO89079 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CopeO89079 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CopeO89079 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CopeO89079 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CopeO89079 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CopeO89079 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CopeO89079 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CopeO89079 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CopeO89079 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CopeO89079 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CopeO89079 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CopeO89079 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CopeO89079 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CopeO89079 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CopeO89079 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CopeO89079 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CopeO89079 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CopeO89079 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CopeO89079 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CopeO89079 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CopeO89079 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CopeO89079 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CopeO89079 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CopeO89079 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CopeO89079 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CopeO89079 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CopeO89079 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CopeO89079 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CopeO89079 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopeO89079 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopeO89079 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CopeO89079 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopeO89079 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CopeO89079 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopeO89079 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopeO89079 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopeO89079 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopeO89079 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CopeO89079 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CopeO89079 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CopeO89079 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopeO89079 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopeO89079 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopeO89079 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CopeO89079 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CopeO89079 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CopeO89079 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CopeO89079 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CopeO89079 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CopeO89079 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CopeO89079 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CopeO89079 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CopeO89079 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CopeO89079 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CopeO89079 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CopeO89079 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CopeO89079 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CopeO89079 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CopeO89079 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CopeO89079 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CopeO89079 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopeO89079 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopeO89079 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CopeO89079 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CopeO89079 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CopeO89079 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CopeO89079 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CopeO89079 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CopeO89079 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CopeO89079 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CopeO89079 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CopeO89079 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CopeO89079 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CopeO89079 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CopeO89079 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CopeO89079 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CopeO89079 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CopeO89079 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms