Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gnpda1O88958 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gnpda1O88958 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gnpda1O88958 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gnpda1O88958 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gnpda1O88958 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gnpda1O88958 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gnpda1O88958 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms