Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
F11rO88792 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F11rO88792 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F11rO88792 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F11rO88792 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
F11rO88792 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F11rO88792 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F11rO88792 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
F11rO88792 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F11rO88792 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F11rO88792 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F11rO88792 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F11rO88792 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
F11rO88792 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F11rO88792 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F11rO88792 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
F11rO88792 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
F11rO88792 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
F11rO88792 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F11rO88792 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
F11rO88792 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
F11rO88792 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
F11rO88792 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F11rO88792 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F11rO88792 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
F11rO88792 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F11rO88792 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
F11rO88792 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F11rO88792 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F11rO88792 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
F11rO88792 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F11rO88792 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
F11rO88792 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F11rO88792 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
F11rO88792 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F11rO88792 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F11rO88792 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F11rO88792 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F11rO88792 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F11rO88792 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F11rO88792 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F11rO88792 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F11rO88792 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F11rO88792 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F11rO88792 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F11rO88792 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F11rO88792 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F11rO88792 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F11rO88792 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F11rO88792 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F11rO88792 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F11rO88792 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F11rO88792 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F11rO88792 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F11rO88792 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F11rO88792 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F11rO88792 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F11rO88792 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F11rO88792 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F11rO88792 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F11rO88792 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
F11rO88792 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F11rO88792 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F11rO88792 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F11rO88792 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F11rO88792 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F11rO88792 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F11rO88792 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F11rO88792 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F11rO88792 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F11rO88792 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F11rO88792 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F11rO88792 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F11rO88792 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F11rO88792 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F11rO88792 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F11rO88792 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F11rO88792 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F11rO88792 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms