Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cacng2O88602 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacng2O88602 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacng2O88602 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacng2O88602 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacng2O88602 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng2O88602 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng2O88602 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacng2O88602 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng2O88602 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacng2O88602 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng2O88602 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng2O88602 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng2O88602 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng2O88602 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacng2O88602 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng2O88602 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng2O88602 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng2O88602 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacng2O88602 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacng2O88602 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacng2O88602 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cacng2O88602 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacng2O88602 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacng2O88602 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacng2O88602 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms