Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tulp3O88413 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tulp3O88413 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tulp3O88413 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tulp3O88413 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tulp3O88413 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tulp3O88413 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms