Protein–RNA interactions for Protein: O70572

Smpd2, Sphingomyelin phosphodiesterase 2, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd2O70572 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smpd2O70572 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smpd2O70572 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smpd2O70572 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smpd2O70572 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Smpd2O70572 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Smpd2O70572 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smpd2O70572 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smpd2O70572 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Smpd2O70572 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smpd2O70572 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Smpd2O70572 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smpd2O70572 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms