Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx3O70492 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx3O70492 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx3O70492 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx3O70492 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx3O70492 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snx3O70492 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx3O70492 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx3O70492 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx3O70492 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx3O70492 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx3O70492 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx3O70492 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx3O70492 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx3O70492 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx3O70492 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx3O70492 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx3O70492 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms