Protein–RNA interactions for Protein: O70422

Gtf2h4, General transcription factor IIH subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h4O70422 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2h4O70422 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf2h4O70422 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf2h4O70422 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf2h4O70422 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2h4O70422 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2h4O70422 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2h4O70422 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms