Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp8O70404 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vamp8O70404 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp8O70404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp8O70404 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms