Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChkbO55229 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkbO55229 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ChkbO55229 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ChkbO55229 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChkbO55229 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ChkbO55229 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ChkbO55229 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChkbO55229 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ChkbO55229 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ChkbO55229 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkbO55229 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChkbO55229 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChkbO55229 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChkbO55229 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChkbO55229 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms