Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtogO55225 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OtogO55225 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtogO55225 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OtogO55225 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OtogO55225 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtogO55225 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtogO55225 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OtogO55225 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OtogO55225 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OtogO55225 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OtogO55225 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtogO55225 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OtogO55225 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OtogO55225 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtogO55225 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtogO55225 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OtogO55225 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtogO55225 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtogO55225 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtogO55225 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OtogO55225 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OtogO55225 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtogO55225 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OtogO55225 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtogO55225 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtogO55225 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OtogO55225 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtogO55225 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtogO55225 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OtogO55225 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OtogO55225 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OtogO55225 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtogO55225 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtogO55225 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OtogO55225 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
OtogO55225 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtogO55225 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtogO55225 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtogO55225 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtogO55225 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OtogO55225 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtogO55225 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OtogO55225 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtogO55225 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtogO55225 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtogO55225 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OtogO55225 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtogO55225 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OtogO55225 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtogO55225 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OtogO55225 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OtogO55225 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtogO55225 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtogO55225 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OtogO55225 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
OtogO55225 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtogO55225 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OtogO55225 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtogO55225 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OtogO55225 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OtogO55225 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtogO55225 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtogO55225 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtogO55225 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtogO55225 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OtogO55225 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtogO55225 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OtogO55225 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtogO55225 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OtogO55225 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtogO55225 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OtogO55225 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtogO55225 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OtogO55225 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtogO55225 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
OtogO55225 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
OtogO55225 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtogO55225 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
OtogO55225 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtogO55225 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtogO55225 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtogO55225 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
OtogO55225 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtogO55225 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtogO55225 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
OtogO55225 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtogO55225 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OtogO55225 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtogO55225 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OtogO55225 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OtogO55225 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtogO55225 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtogO55225 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OtogO55225 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms