Protein–RNA interactions for Protein: O55189

Ambn, Ameloblastin, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbnO55189 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AmbnO55189 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmbnO55189 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AmbnO55189 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AmbnO55189 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AmbnO55189 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AmbnO55189 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmbnO55189 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmbnO55189 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AmbnO55189 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
AmbnO55189 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AmbnO55189 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AmbnO55189 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AmbnO55189 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AmbnO55189 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmbnO55189 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AmbnO55189 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AmbnO55189 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms