Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlx3O55144 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlx3O55144 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tlx3O55144 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlx3O55144 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tlx3O55144 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tlx3O55144 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tlx3O55144 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms