Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnd2O35927 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ctnnd2O35927 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ctnnd2O35927 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnnd2O35927 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnnd2O35927 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnnd2O35927 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd2O35927 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd2O35927 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctnnd2O35927 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms