Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1dO35473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1dO35473 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1dO35473 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1dO35473 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1dO35473 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1dO35473 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1dO35473 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1dO35473 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1dO35473 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1dO35473 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1dO35473 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1dO35473 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1dO35473 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1dO35473 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1dO35473 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1dO35473 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1dO35473 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1dO35473 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1dO35473 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1dO35473 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1dO35473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1dO35473 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1dO35473 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1dO35473 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1dO35473 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1dO35473 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1dO35473 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1dO35473 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1dO35473 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1dO35473 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1dO35473 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1dO35473 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1dO35473 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1dO35473 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1dO35473 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1dO35473 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1dO35473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1dO35473 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1dO35473 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1dO35473 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1dO35473 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1dO35473 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1dO35473 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1dO35473 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1dO35473 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1dO35473 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1dO35473 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1dO35473 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1dO35473 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1dO35473 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1dO35473 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1dO35473 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1dO35473 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1dO35473 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1dO35473 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1dO35473 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1dO35473 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1dO35473 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1dO35473 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1dO35473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1dO35473 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1dO35473 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1dO35473 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1dO35473 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1dO35473 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1dO35473 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1dO35473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1dO35473 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms