Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gata2O09100 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gata2O09100 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gata2O09100 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gata2O09100 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gata2O09100 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata2O09100 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata2O09100 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gata2O09100 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gata2O09100 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gata2O09100 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gata2O09100 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gata2O09100 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata2O09100 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gata2O09100 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata2O09100 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata2O09100 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gata2O09100 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gata2O09100 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms