Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec22bO08547 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec22bO08547 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sec22bO08547 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sec22bO08547 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sec22bO08547 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec22bO08547 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec22bO08547 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec22bO08547 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec22bO08547 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec22bO08547 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms