Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spin2fJ3QPU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spin2fJ3QPU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spin2fJ3QPU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spin2fJ3QPU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spin2fJ3QPU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spin2fJ3QPU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spin2fJ3QPU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms