Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20830J3KML6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm20830J3KML6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm20830J3KML6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20830J3KML6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20830J3KML6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20830J3KML6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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